瓦楞纸包装箱数码印刷机用到的材料是瓦楞纸，人们运输包装选择瓦楞纸板，有两大原因，一是便宜，二是坚固耐用。尽管印刷质量的水平已有所提高，在包装盒上增加品牌识别度的趋势并没有完全改变这些模式。

　　这给喷墨技术带来了一些挑战。喷墨的性能很大程度上取决于基材。最便宜且使用最广泛的瓦楞纸板表面为褐色，粗糙且吸收性很强。短版订单往往具有更高的价值，因此用户更有可能使用带有白牛卡纸以获得更好的印刷与产品质量。此外，需要配合使用正确的油墨，这也具有挑战性，特别是因为成本应该较低，并且覆盖率可以很高，这使得油墨成本成为重要的考虑因素。

　　瓦楞纸的后印面临的挑战更多。纸板很大，需要比较宽范围的喷墨阵列。纸板的表面通常是波浪状且多尘的，因此喷头需要保持一定的安全距离。笨重的纸板会引起空气干扰，这也会影响印刷质量。瓦楞纸印刷的环境条件通常很苛刻，而印刷机需要在这种环境中运行，因为并非所有工厂都愿意(或能够)为喷墨印刷机创建干净的区域。

　　幸运的是，在纸箱上印刷的质量期望不如图形艺术的要求那么高。尽管存在能够印刷非常高质量的后印喷墨解决方案，但即使是中等分辨率的印刷机也可以获得优于传统柔印的结果。通过使用图形艺术级的面纸，预印可以提供非常高的质量。但是，由于分两步进行，因此预印成本更高，且灵活性更低。